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[UE 1] transcription arnm | eucaryotes | les facteurs(Résolue)

Question

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samson34
Membre
Médecine Montpellierbonjour je suis un peu perdu dans le cour de mAUdelode je mélange les facteurs trans et facteurs généraux de la transcrition . est ce que ce serais possible d’avoir un petit récap sur tout ca.
car je pensais que facteur généraux = facteur transcriptionnel qu’on vois avec pujols en ue2. or ces facteurs transcriptionnels serais les facteurs trans qui interviennent plus tard ????
car il dit dans une dipo que « CIT (ARNpol2+facteur généraux de la transcription) seul est peut efficace » et que d’autres facteurs sont nécessaires » les facteurs trans régulateurs de la transcription »

bref c’est le bordel dans ma tête. En gros est ce qu’il y a une différence entre les facteurs généraux de la transcriptions et les facteurs trans régulateurs de la transcription.

et autre chose. il dit que des sqces en amont ou en aval du site de transcription peuvent remplacer la boite tata. or je pensais que les promoteurs devais toujours se trouver en amont du site de transcription…

Parsamson34le27/11/2014 à 17h19Avertir les modérateurs Non respect de la charte

Réponses

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Muspel
Tuteur simple
Médecine NîmesBonjour =)

Facteur cis = séquence d’ADN régulatrice

Exemples de facteurs cis

  • Boîte TATA (ou promoteur basal)
  • Séquences régulatrices proximales (comme les boîtes CG ou CAAT)
  • Séquences régulatrices distales (en aval ou en amont, voir en intragénique au niveau des introns mais Mr. Maudelonde n’en parle pas)

Facteur trans = protéines permettant de faire s’exprimer ce séquences

Exemples de facteurs trans

  • Facteurs généraux de la transcription (comme TFIID via sa sous-unité TBP qui va sur la boîte TATA)
  • Facteur SP1 liant la boîte CG
  • Facteurs NF1 ou CTF liant la boîte CAAT

L’initiation de la transcription se déroule selon plusieurs étapes [les étapes à ne pas retenir par cœur sont entre crochets]

  1. Arrivée de TFIID (sa sous-unité TBP reconnaît la boîte TATA)
  2. [Arrivée de TFIIA et TFIIB]
  3. Recrutement de l’ARNpol. II [associée à TFIIF]
  4. Arrivée de TFIIH [et TFIIE]
  5. Phosphorylation de l’extrémité CTD (C-term) de l’ARN pol. II via TFIIH (qui possède une activité kinase), ce qui dissocie le complexe et marque le début de la transcription

J’espère t’avoir répondu et éclairéheureux

Bon courage !

Maxime Maurey
Tuteur stagiaire en UE1 (TSN)

ParMuspelle28/11/2014 à 12h12Avertir les modérateurs Non respect de la charte...
samson34
Membre
Médecine MontpellierMerci ++++
Mais a propos de la transcription chez les eucaryotes il faut un promoteur basal+ promoteur proximal(CAAT ou GC) ??? il faut les 2 ?

ensuite il dit que les HMT favorise l’euchromatine puis ensuite quand il parle du code histone je crois sur la queue n-term il dit qu’une méthylation sur cette queue peut entrainer un condensation de l’adn
on retient quoi pour le coup ?

juste pour savoir si j’ai bien compris. Il y a les facteurs trans, parmis lesquels on a :
– les facteurs d’initiation (les TFII*).
-facteurs d’élongations qui se dimérisent pour réguler la transcription en association avec les cofacteurs ?

merci d’avance 🙂

Parsamson34le01/12/2014 à 17h34Avertir les modérateurs Non respect de la charte...
Muspel
Tuteur simple
Médecine Nîmes

Mais a propos de la transcription chez les eucaryotes il faut un promoteur basal + promoteur proximal (CAAT ou GC) ??? il faut les 2 ?

Il faut OBLIGATOIREMENT le promoteur basal (boîte TATA) et FACULTATIVEMENT le promoteur proximal, pouvant être constitué de CG et/ou CAAT.

Ensuite il dit que les HMT favorise l’euchromatine puis ensuite quand il parle du code histone je crois sur la queue n-term il dit qu’une méthylation sur cette queue peut entrainer un condensation de l’adn.
on retient quoi pour le coup ?

Alors déjà pour le coup de N-term, tu verras ça en TIG au second quad : les modifs des histones ne se font QUE en N-term car « c’est ce qui dépasse ».

Ensuite il peut y avoir plusieurs cas de figure

  • Méthylation de l’ADN : SEULE modif épigénétique possible, entraînant une inhibition de la transcription (car condensation de la chromatine)
  • Méthylation des histones : ouverture des histones = décondensation de la chromatine = favorise la transcription
  • Acétylation des histones : favorise la transcription
  • Phosphorylation des histones : à ne pas retenir pour l’UE1, c’est juste pour te citer toutes les possibilités

Juste pour savoir si j’ai bien compris. Il y a les facteurs trans, parmi lesquels on a :
– les facteurs d’initiation (les TFII*).
– facteurs d’élongations qui se dimérisent pour réguler la transcription en association avec les cofacteurs ?

Alors pour les TFII*, Mr Maudelonde les appelle clairement « facteurs généraux de la transcription », faisant partie du complexe d’initiation de la transcription (quand on rajoute ARN pol. II).
Ce qui me gène dans ce que tu dis c’est qu’à aucun moment Mr Maudelonde ne parle clairement de « facteurs d’initiation », et il énonce vite fait le terme « facteurs d’élongation », mais sans préciser de quoi il s’agit.
Attention à ne pas confondre « facteurs intervenant lors de l’initiation » et « facteurs d’initiation ».

Facteurs intervenant lors de l’initiation -> facteurs généraux de la transcription
Facteurs d’initiation -> non dit

En fait pour t’expliquer (mais attention j’insiste : Mr Maudelonde n’en parle pas !!) : parmi les facteurs généraux de la transcription (les TFII*) on retrouve des facteurs d’initiation et des facteurs d’élongation, mais ces deux familles comportent encore d’autres protéines.
Bref c’est compliqué et pas dans le cours donc ne cherche pas à te rajouter des difficultés oeil

Petit bilan pour y voir quand même clair

  • Facteurs généraux de la transcription : TFII[A/B/D/E/F/H]
  • Facteurs d’initiation : notamment certains facteurs généraux + autres
  • Facteurs d’élongation (non vus !!) : TFIIF, élongine, ELL, TFIIS, P-TEFb, DSIF, NELF, Facteur 2 et FACT (donc pour répondre à ta dernière question, non ce n’est pas exactement ça, mais ce que tu me décris sont bien des facteurs trans

J’ai essayé d’être précis pour te faire bien comprendre, mais le cours ne l’est pas autant, alors si jamais Mr Maudelonde assimile les facteurs TFII* comme étant des facteurs d’initiation NE MET SURTOUT PAS FAUX !!
Ce cours porte sur des généralités de notions encore floues au niveau de la recherche donc sois malin et ne va pas chercher des pièges inexistants (SURTOUT sur les QCM de Mr Maudelonde !)

Maxime Maurey
Tuteur stagiaire en UE1 (TSN)

ParMuspelle01/12/2014 à 23h36Avertir les modérateurs Non respect de la charte

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